بیماری های داخلی به طیف گسترده ای از بیماری ها اطلاق می شود  که بایستی حتما قبل از هرگونه اقدام جهت بارداری طبیعی و یا در صورت بروز ناباروری قبل از هرگونه اقدام کمک باروری مورد بررسی دقیق و جدی توسط متخصص داخلی قرار گیرد. مهمترین بیماری هایی که بایستی در پروسه ی درمان ناباروری مورد بررسی قرار گیرند، موارد زیر می باشند: دیابت، فشار و چربی افزایش یافته خون، کم خونی، بیماری های تنفسی، بیماری های عفونی، مشکلات کبدی، مشکلات غدد، تیروئید، قلب و عروق، کلیه ها، روماتیسم و…